Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMC4Q9NTJ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC4Q9NTJ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC4Q9NTJ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms