Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL1Q9NSC2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SALL1Q9NSC2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms