Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT82Q9NSB4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms