Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO6Q9NRD1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO6Q9NRD1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO6Q9NRD1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO6Q9NRD1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO6Q9NRD1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO6Q9NRD1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO6Q9NRD1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO6Q9NRD1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO6Q9NRD1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO6Q9NRD1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO6Q9NRD1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO6Q9NRD1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO6Q9NRD1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms