Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
CD163L1Q9NR16 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CD163L1Q9NR16 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CD163L1Q9NR16 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms