Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A4GALTQ9NPC4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms