Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms