Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAS3Q9H6U6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms