Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C20orf27Q9GZN8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C20orf27Q9GZN8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C20orf27Q9GZN8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C20orf27Q9GZN8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C20orf27Q9GZN8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C20orf27Q9GZN8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C20orf27Q9GZN8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C20orf27Q9GZN8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C20orf27Q9GZN8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
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C20orf27Q9GZN8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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C20orf27Q9GZN8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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C20orf27Q9GZN8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.29■■□□□ 1
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C20orf27Q9GZN8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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C20orf27Q9GZN8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C20orf27Q9GZN8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C20orf27Q9GZN8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C20orf27Q9GZN8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C20orf27Q9GZN8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C20orf27Q9GZN8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C20orf27Q9GZN8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C20orf27Q9GZN8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C20orf27Q9GZN8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C20orf27Q9GZN8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C20orf27Q9GZN8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C20orf27Q9GZN8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C20orf27Q9GZN8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C20orf27Q9GZN8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C20orf27Q9GZN8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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