Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR88Q9GZN0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR88Q9GZN0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms