Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms