Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABARAPL3Q9BY60 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms