Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RNF17Q9BXT8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
RNF17Q9BXT8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms