Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms