Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms