Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCMBPQ9BTE3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCMBPQ9BTE3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms