Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms