Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTA3Q9BTC8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTA3Q9BTC8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms