Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MXRA8Q9BRK3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MXRA8Q9BRK3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MXRA8Q9BRK3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MXRA8Q9BRK3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MXRA8Q9BRK3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MXRA8Q9BRK3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MXRA8Q9BRK3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MXRA8Q9BRK3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MXRA8Q9BRK3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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