Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF559Q9BR84 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms