Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2Q9BQY4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2Q9BQY4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms