Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP3Q9BQQ7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms