Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGME1Q9BQP7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms