Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms