Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPGQ9BPX3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms