Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBBP8Q99708 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms