Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRQ99707 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRQ99707 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRQ99707 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRQ99707 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRQ99707 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRQ99707 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRQ99707 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRQ99707 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRQ99707 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRQ99707 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTRQ99707 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTRQ99707 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTRQ99707 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTRQ99707 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRQ99707 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRQ99707 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRQ99707 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRQ99707 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRQ99707 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRQ99707 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRQ99707 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRQ99707 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRQ99707 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRQ99707 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRQ99707 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRQ99707 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRQ99707 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRQ99707 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRQ99707 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRQ99707 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRQ99707 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRQ99707 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRQ99707 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRQ99707 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRQ99707 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRQ99707 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRQ99707 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRQ99707 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRQ99707 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRQ99707 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRQ99707 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRQ99707 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRQ99707 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRQ99707 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRQ99707 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRQ99707 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRQ99707 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRQ99707 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRQ99707 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRQ99707 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRQ99707 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRQ99707 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRQ99707 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRQ99707 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRQ99707 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRQ99707 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRQ99707 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRQ99707 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRQ99707 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRQ99707 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRQ99707 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRQ99707 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRQ99707 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRQ99707 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRQ99707 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRQ99707 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRQ99707 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRQ99707 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRQ99707 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms