Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms