Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD5Q99666 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD5Q99666 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms