Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMD1Q99460 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD1Q99460 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms