Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP3Q96KP6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms