Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC45A3Q96JT2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms