Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRELD1Q96HD1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms