Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MVB12AQ96EY5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MVB12AQ96EY5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms