Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCTD12Q96CX2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCTD12Q96CX2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms