Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RUNDC1Q96C34 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RUNDC1Q96C34 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms