Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYTL4Q96C24 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms