Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1MTQ969P6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms