Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCE1Q969G3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCE1Q969G3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms