Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAMP4Q969E2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms