Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMARCD2Q92925 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMARCD2Q92925 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCD2Q92925 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms