Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CSRNP3Q8WYN3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CSRNP3Q8WYN3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CSRNP3Q8WYN3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CSRNP3Q8WYN3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CSRNP3Q8WYN3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CSRNP3Q8WYN3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CSRNP3Q8WYN3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CSRNP3Q8WYN3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CSRNP3Q8WYN3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CSRNP3Q8WYN3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CSRNP3Q8WYN3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CSRNP3Q8WYN3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CSRNP3Q8WYN3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CSRNP3Q8WYN3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms