Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ7

ABCA5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA5Q8WWZ7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCA5Q8WWZ7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCA5Q8WWZ7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCA5Q8WWZ7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCA5Q8WWZ7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA5Q8WWZ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCA5Q8WWZ7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms