Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf54Q8WWF1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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