Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
HELBQ8NG08 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HELBQ8NG08 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms