Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms