Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms