Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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CLDN19Q8N6F1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN19Q8N6F1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
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CLDN19Q8N6F1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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CLDN19Q8N6F1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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CLDN19Q8N6F1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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CLDN19Q8N6F1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN19Q8N6F1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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