Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms