Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SKAP1Q86WV1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SKAP1Q86WV1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKAP1Q86WV1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms